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コンピュータ将棋など…。
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エンジンのほうは標準出力と標準入力を使っているので、GUIはエンジンを子プロセスとして起動して、その入出力をGUI側から操作したい…というのをいろいろ検索して見つけました。

マイクロソフトサポートの「コンソール プロセスを生成して標準ハンドルをリダイレクトする方法」(http://support.microsoft.com/kb/190351/ja)

実に求めている内容っぽい。使っている API は Win32 だけど UNIX では普通にやってそうな感じでしょうか(こういうプログラムの経験はないけど…)。

第二歩があるかどうかは未定。
GUI作成も未定。といいながら、WCSC21のなのはは内部的なI/FはUSIライクになっていて、同一プロセス内でメッセージでエンジン部とGUI部を制御しようとして中途半端な実装になっていましたw
なのは詰めがわりと簡単にUSI対応できたのはそのおかげかな?
まずはエンジン部のUSI対応版を作ろう。
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